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MetabolomicsBasics (R package to process and analyze metabolomics datasets)

  • Raw data from metabolomics experiments are initially subjected to peak identification and signal deconvolution to generate raw data matrices m × n, where m are samples and n are metabolites. We describe here simple statistical procedures on such multivariate data matrices, all provided as functions in the programming environment R, useful to normalize data, detect biomarkers, and perform sample classification.

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Metadaten
Autor*innen:Jan LisecORCiD
Koautor*innen:Carsten Jaeger
Dokumenttyp:Forschungsdatensatz
Veröffentlichungsform:Graue Literatur
Sprache:Englisch
Jahr der Erstveröffentlichung:2018
Organisationseinheit der BAM:1 Analytische Chemie; Referenzmaterialien
1 Analytische Chemie; Referenzmaterialien / 1.7 Organische Spuren- und Lebensmittelanalytik
1 Analytische Chemie; Referenzmaterialien / 1.8 Umweltanalytik
Herausgeber (Institution):Bundesanstalt für Materialforschung und -prüfung (BAM)
Verlag:GitHub
Verlagsort:San Francisco, CA, USA
DDC-Klassifikation:Naturwissenschaften und Mathematik / Chemie / Analytische Chemie
Freie Schlagwörter:Data processing; Mass Spectrometry; R package; Software
Themenfelder/Aktivitätsfelder der BAM:Chemie und Prozesstechnik
Art der Ressource:Software
URL:https://github.com/cran/MetabolomicsBasics/
Zugehöriger Identifikator:https://link.springer.com/protocol/10.1007/978-1-4939-7819-9_20
Verfügbarkeit des Dokuments:Datei für die Öffentlichkeit verfügbar ("Open Access")
Lizenz (Deutsch):License LogoCreative Commons - CC BY - Namensnennung 4.0 International
Datum der Freischaltung:06.07.2023
Referierte Publikation:Nein
Schriftenreihen ohne Nummerierung:Forschungsdatensätze der BAM
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