• Treffer 1 von 1
Zurück zur Trefferliste

Data-Parallel MRI Brain Segmentation in Clinicial Use

  • Structural MRI brain analysis and segmentation is a crucial part in the daily routine in neurosurgery for intervention planning. Exemplarily, the free software FSL-FAST (FMRIB’s Segmentation Library – FMRIB’s Automated Segmentation Tool) in version 4 is used for segmentation of brain tissue types. To speed up the segmentation procedure by parallel execution, we transferred FSL-FAST to a General Purpose Graphics Processing Unit (GPGPU) using Open Computing Language (OpenCL) [1]. The necessary steps for parallelization resulted in substantially different and less useful results. Therefore, the underlying methods were revised and adapted yielding computational overhead. Nevertheless, we achieved a speed-up factor of 3.59 from CPU to GPGPU execution, as well providing similar useful or even better results.

Metadaten exportieren

Weitere Dienste

Teilen auf Twitter Suche bei Google Scholar Anzahl der Zugriffe auf dieses Dokument
Metadaten
Verfasserangaben:Joachim Weber, Christian Doenitz, Alexander BrawanskiORCiD, Christoph PalmORCiDGND
DOI:https://doi.org/10.1007/978-3-662-46224-9_67
Titel des übergeordneten Werkes (Deutsch):Bildverarbeitung für die Medizin 2015; Algorithmen - Systeme - Anwendungen; Proceedings des Workshops vom 15. bis 17. März 2015 in Lübeck
Untertitel (Deutsch):Porting FSL-Fastv4 to GPGPUs
Verlag:Springer
Verlagsort:Berlin
Dokumentart:Konferenzveröffentlichung (Beitrag)
Sprache der Veröffentlichung:Englisch
Jahr der Veröffentlichung:2015
Datum der Freischaltung:20.12.2019
Freies Schlagwort / Tag:Brain Segmentation; General Purpose Graphic Processing Unit; Magnetic Resonance Imaging; Parallel Execution; Voxel Spacing
GND-Schlagwort:Kernspintomografie; Gehirn; Bildsegmentierung; Parallelverarbeitung
Erste Seite:389
Letzte Seite:394
Fakultäten / Institute / Einrichtungen:Fakultät Informatik und Mathematik
Regensburg Center of Biomedical Engineering - RCBE
Fakultät Informatik und Mathematik / Regensburg Medical Image Computing (ReMIC)
Begutachtungsstatus:peer-reviewed
Forschungsschwerpunkt:Lebenswissenschaften und Ethik
Lizenz (Deutsch):Keine Lizenz - Es gilt das deutsche Urheberrecht: § 53 UrhG