TY - GEN A1 - Bütow, Sandra M. A1 - Pänke, Oliver A1 - Kafka, Jan A1 - Lisdat, Fred T1 - Goldchipelektroden zur elektrochemischen DNA-Detektion T2 - Wissenschaftliche Beiträge 2008 N2 - Im folgenden Artikel werden einfache DNA-Sensoren vorgestellt, mit deren Hilfe es durch voltammetrische und impedimetrische Messmethoden möglich ist, schnell, sensitiv und kostengünstig Einzelstrang-DNA (ssDNA) nachzuweisen. Beide Messprinzipien lassen neben der spezifischen Detektion auch die Quantifizierung von DNA-Sequenzen sowie den Nachweis von einzelnen Basenfehlpaarungen innerhalb dieser Sequenzen zu. Fänger- DNA wurde zu diesem Zweck mit dem 5’-Ende auf einer Goldoberfläche immobilisiert. Die Hybridisierung mit einem Methylenblau (MB) markierten oder unmarkierten Probenstrang konnte dann mit Hilfe der Differenzpulsvoltammetrie DPV oder der elektrochemischen Impedanzspektroskopie nachgewiesen werden. Die voltammetrische Quantifizierung erfolgte in einem direkten und kompetitiven Ansatz, mit einem Detektionslimit von 30 nM bzw. 3 nM (bei Einsatz von 0,1 μM Kompetitor- DNA). Das Detektionslimit beim impedimetrischen Nachweis lag bei 100 nM DNA. Die hier vorgestellten Sensoren sind zum einen regenerierbar und können zum anderen über einen Zeitraum von zwei Monaten gelagert werden. N2 - This paper describes simplistic electrochemical DNA sensors for the sensitive, more rapid and cost effective detection of single-stranded DNA (ssDNA). The used methodes are the voltammetric detection and the detection by impedance spectroscopy. Beside the specific detection of ssDNA both techniques allow quantification of DNA and verification of single base pair mismatches within the sequences. Therefore a single-stranded 18mer oligonucleotide (DNA) was immobilised via a thiol-linker on gold film electrodes and served as probe DNA. Hybridisation was detected by means of the electroactive redox-marker methylene blue (MB), which was covalently bound to the 5’-end of the target DNA, by differential pulse voltammetry (DPV) or by measuring the differences in the charge transfer resistance (RCT) by electrochemical impedance spectroscopy (EIS) using non-labelled ssDNA targets. MB-labelled target DNA was verified down to 30 nM DNA. By application of a competitive binding assay non-labelled DNA was detected down to 3 nM DNA. The detection limit for impedimetric DNA sensors was 100 nM ssDNA. The sensors were found to be reusable and could be stored for more than two month at 4 °C without significant loss in their activity. Y1 - 2008 U6 - http://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:kobv:526-opus-653 SN - 0949-8214 VL - 13 SP - 25 EP - 34 ER - TY - JOUR A1 - Nitsche, Andreas A1 - Kurth, Andreas A1 - Dunkhorst, Anna A1 - Pänke, Oliver A1 - Sielaff, Hendrik A1 - Junge, Wolfgang A1 - Muth, Doreen A1 - Scheller, Frieder W. A1 - Stöcklein, Walter A1 - Dahmen, Claudia A1 - Pauli, Georg A1 - Kage, Andreas T1 - One-step selection of Vaccinia virus-binding DNA aptamers by MonoLEX JF - BMC Biotechnology N2 - As a new class of therapeutic and diagnostic reagents, more than fifteen years ago RNA and DNA aptamers were identified as binding molecules to numerous small compounds, proteins and rarely even to complete pathogen particles. Most aptamers were isolated from complex libraries of synthetic nucleic acids by a process termed SELEX based on several selection and amplification steps. Here we report the application of a new one-step selection method (MonoLEX) to acquire high-affinity DNA aptamers binding Vaccinia virus used as a model organism for complex target structures. Y1 - 2007 U6 - http://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:kobv:526-opus4-6246 SN - 1472-6750 VL - 7 IS - 48 ER -