@misc{LisdatBeissenhirtzSchelleretal.2006, author = {Lisdat, Fred and Beissenhirtz, Moritz K. and Scheller, Frieder W. and Viezzoli, Maria S.}, title = {Cystein-Mutanten der Cu,Zn-Superoxiddismutase und ihre Anwendung in Proteinelektroden f{\"u}r die Detektion von freien Sauerstoffradikalen}, series = {Wissenschaftliche Beitr{\"a}ge 2006}, volume = {11}, journal = {Wissenschaftliche Beitr{\"a}ge 2006}, issn = {0949-8214}, doi = {10.15771/0949-8214_2006_1_1}, url = {http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:kobv:526-opus-216}, pages = {7 -- 11}, year = {2006}, abstract = {Das Enzym Superoxiddismutase (SOD) bietet wegen seiner hohen Reaktionsrate und seiner extrem hohen Substratspezifi t{\"a}t große Vorteile f{\"u}r eine Anwendung als Superoxidbiosensor. In dieser Arbeit wurden durch molekularbiologische Methoden Mutanten der humanen Cu,Zn-SOD gewonnen, welche ein oder zwei zus{\"a}tzliche Cystein-Reste enthielten, die eine einfache Immobilisierung des Proteins durch Bindung des Cystein-Schwefels auf Goldelektroden erm{\"o}glichten. Sechs solcher Mutanten wurden entworfen, exprimiert, aufgereinigt und elektrochemisch charakterisiert. Alle Mutanten konnten durch einen einfachen Inkubationsschritt auf Goldelektroden gebunden werden und zeigten ein quasi-reversibles elektrochemisches Ansprechen. F{\"u}r eine Mutante wurde die Anwendung als Superoxidsensor genauer untersucht und f{\"u}r beide Teilreaktionen der Dismutation ein Ansprechen des Sensors auf das Radikal gefunden. Bei Verwendung einer Teilreaktion konnte die Empfindlichkeit herk{\"o}mmlicher Monoschichtsensoren um etwa eine Gr{\"o}ßenordnung {\"u}bertroffen werden.}, language = {de} } @misc{TerschLisdat2012, author = {Tersch, Christoph and Lisdat, Fred}, title = {Labelfreie Detektion von Protein-DNA-Interaktionen durch elektrochemische Impedanzspektroskopie}, series = {Wissenschaftliche Beitr{\"a}ge 2012}, volume = {16}, journal = {Wissenschaftliche Beitr{\"a}ge 2012}, issn = {0949-8214}, doi = {10.15771/0949-8214_2012_1_3}, url = {http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:kobv:526-opus-1346}, pages = {23 -- 30}, year = {2012}, abstract = {Es wird ein impedimetrisches Sensorsystem f{\"u}r den Nachweis von Protein-DNA-Wechselwirkungen vorgestellt. Der Sensor nutzt kurze Thiol-markierte DNA (ssDNA), die {\"u}ber Chemisorption auf Goldchipelektroden immobilisiert wird. Aus den Impedanzspektren wurde der Durchtrittswiderstand (Rct) als Kenngr{\"o}ße f{\"u}r die zu untersuchenden Wechselwirkungen gew{\"a}hlt. In Anwesenheit des Redoxsystems Ferro-/Ferrycyanid konnte eine Zunahme des Durchtrittswiderstandes nach der Immobilisierung und anschließender Hybridisierung auf der Sensoroberfl {\"a}che registriert werden. Der Einsatz l{\"a}ngerer F{\"a}nger-DNA (25- mer im Vergleich zu 18-mer) f{\"u}hrte zu einer Abnahme der Konzentration an immobilisierten F{\"a}nger-Str{\"a}ngen, aber auch zu einer Vergr{\"o}ßerung der Durchtrittswiderst{\"a}nde sowohl f{\"u}r ssDNA als auch dsDNA. Bei {\"a}hnlichen Oberfl{\"a}chenkonzentrationen ließ sich eine ann{\"a}hernd gleiche Sensitivit{\"a}t des Hybridisierungsnachweises im Vergleich zu 18-mer F{\"a}nger-Str{\"a}ngen erzielen. Mit Hilfe des Elektrodensystems wurde die Nachweisbarkeit von Protein-DNA-Wechselwirkungen untersucht. Die Restriktion doppelstr{\"a}ngiger DNA durch die Restriktionsendonuklease BamHI konnte mit der Zyklovoltammetrie und markierungsfrei mit der Impedanzspektroskopie verfolgt werden. Des Weiteren wurde die sequenzspezifische Bindung des Transkriptionsfaktors NF-κB p50 an}, language = {de} } @misc{TanneSchaeferKhalidetal.2012, author = {Tanne, Johannes and Sch{\"a}fer, Daniel and Khalid, Waqas and Parak, Wolfgang J. and Lisdat, Fred}, title = {Lichtgesteuerter bioelektrochemischer Sensor basierend auf CdSe/ZnS-Quantum Dots}, series = {Wissenschaftliche Beitr{\"a}ge 2012}, volume = {16}, journal = {Wissenschaftliche Beitr{\"a}ge 2012}, issn = {0949-8214}, doi = {10.15771/0949-8214_2012_1_2}, url = {http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:kobv:526-opus-1357}, pages = {15 -- 22}, year = {2012}, abstract = {Diese Studie besch{\"a}ftigt sich mit der Untersuchung der Sauerstoffsensitivit{\"a}t von QD-Elektroden auf Basis von CdSe/ZnS-Nanopartikeln. Das Verhalten des sauerstoffabh{\"a}ngigen Photostroms wurde dabei in Abh{\"a}ngigkeit des pH-Wertes und des Potentials untersucht. Auf Grundlage dieser Sauerstoffabh{\"a}ngigkeit wurde die Enzymaktivit{\"a}t von GOD {\"u}ber Photostrommessungen evaluiert. F{\"u}r die Konstruktion eines photobioelektrochemischen Sensors, der durch Beleuchtung der entsprechenden Elektrodenfl{\"a}che ausgelesen werden kann, wurden Multischichten auf die CdSe/ZnS-modifizierten Elektroden aufgetragen. Die Layer-by-Layer Deposition von GOD mit Hilfe des Polyelektrolyten PAH zeigte, dass eine Sensorkonstruktion m{\"o}glich ist. Die Sensoreigenschaften dieser Elektroden werden drastisch durch die Menge an immobilisiertem Enzym auf der Quantum Dot-Schicht beeinflusst. Durch die Pr{\"a}paration von vier Bilayern [GOD/PAH]4 an CdSe/ ZnS Elektroden kann ein schnell ansprechbarer Sensor f{\"u}r Konzentrationen zwischen 0.1 - 5 mM Glukose hergestellt werden. Dies er{\"o}ffnet neue M{\"o}glichkeiten f{\"u}r die Multianalytdetektion mit nichtstrukturierten Sensorelektroden, lokalisierten Enzymen und r{\"a}umlich aufgel{\"o}ster Auslesung durch Licht.}, language = {de} } @misc{BalkenhohlBeutlerSchaeferetal.2007, author = {Balkenhohl, Thomas and Beutler, Falko and Sch{\"a}fer, Daniel and Lisdat, Fred}, title = {Entwicklung eines impedimetrischen Biosensors f{\"u}r den Nachweis von Antigliadin Autoantik{\"o}rpern}, series = {Wissenschaftliche Beitr{\"a}ge 2007}, volume = {12}, journal = {Wissenschaftliche Beitr{\"a}ge 2007}, issn = {0949-8214}, doi = {10.15771/0949-8214_2007_1_8}, url = {http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:kobv:526-opus-522}, pages = {48 -- 57}, year = {2007}, abstract = {In der vorliegenden Arbeit wurde ein Biosensor f{\"u}r den Nachweis von Antik{\"o}rpern gegen Gliadin entwickelt. Gliadine sind Bestandteile der Getreideglutene und verantwortlich f{\"u}r die Manifestation der Z{\"o}liakie (Gluten-Unvertr{\"a}glichkeit). Der Biosensor basiert auf der Immobilisierung von Gliadin auf Goldelektroden, die zuvor mit Polystyrensulfons{\"a}ure beschichtet worden waren. Die erfolgreiche Immobilisierung wurde mit Hilfe der Quarzmikrowaage dokumentiert. Die Antigen-Antik{\"o}rper-Bindung konnte durch die Inkubation mit einem Peroxidase-markierten Zweitantik{\"o}rper und der enzymatischen Oxidation von 3-Amino-9- Ethylcarbazol (AEC) verst{\"a}rkt werden. Die Zunahme in der Elektrodenisolierung durch die Bindungs- und Ablagerungsreaktion konnte durch elektrochemische Impedanzspektroskopie (EIS) in Anwesenheit des Hexacyanoferrat- Redoxsystems gemessen werden. Die Spektren wurden mit Hilfe eines Randles-Ersatzschaltbildes ausgewertet. Hierbei konnte eine Zunahme im Ladungstransferwiderstand festgestellt werden, die pro portional zur Antigliadin-Antik{\"o}rperkonzentration, im Bereich von 10-8 M bis 10-6 M, war. Mit Hilfe dieses Sensors wurden schließlich humane Seren hinsichtlich ihrer Konzentration an Gliadinantik{\"o}rpern, sowohl f{\"u}r Immunglobuline vom Typ IgG als auch IgA, untersucht.}, language = {de} } @misc{BuetowPaenkeKafkaetal.2008, author = {B{\"u}tow, Sandra M. and P{\"a}nke, Oliver and Kafka, Jan and Lisdat, Fred}, title = {Goldchipelektroden zur elektrochemischen DNA-Detektion}, series = {Wissenschaftliche Beitr{\"a}ge 2008}, volume = {13}, journal = {Wissenschaftliche Beitr{\"a}ge 2008}, issn = {0949-8214}, doi = {10.15771/0949-8214_2008_1_4}, url = {http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:kobv:526-opus-653}, pages = {25 -- 34}, year = {2008}, abstract = {Im folgenden Artikel werden einfache DNA-Sensoren vorgestellt, mit deren Hilfe es durch voltammetrische und impedimetrische Messmethoden m{\"o}glich ist, schnell, sensitiv und kosteng{\"u}nstig Einzelstrang-DNA (ssDNA) nachzuweisen. Beide Messprinzipien lassen neben der spezifischen Detektion auch die Quantifizierung von DNA-Sequenzen sowie den Nachweis von einzelnen Basenfehlpaarungen innerhalb dieser Sequenzen zu. F{\"a}nger- DNA wurde zu diesem Zweck mit dem 5'-Ende auf einer Goldoberfl{\"a}che immobilisiert. Die Hybridisierung mit einem Methylenblau (MB) markierten oder unmarkierten Probenstrang konnte dann mit Hilfe der Differenzpulsvoltammetrie DPV oder der elektrochemischen Impedanzspektroskopie nachgewiesen werden. Die voltammetrische Quantifizierung erfolgte in einem direkten und kompetitiven Ansatz, mit einem Detektionslimit von 30 nM bzw. 3 nM (bei Einsatz von 0,1 μM Kompetitor- DNA). Das Detektionslimit beim impedimetrischen Nachweis lag bei 100 nM DNA. Die hier vorgestellten Sensoren sind zum einen regenerierbar und k{\"o}nnen zum anderen {\"u}ber einen Zeitraum von zwei Monaten gelagert werden.}, language = {de} } @misc{SchubertKhalidZhaoetal.2010, author = {Schubert, Kirsten and Khalid, Waqas and Zhao, Yue and Parak, Wolfgang J. and Lisdat, Fred}, title = {Halbleiternanopartikel-modifizierte Elektrode zum Nachweis von Substraten von NADH-abh{\"a}ngigen Enzymreaktionen}, series = {Wissenschaftliche Beitr{\"a}ge 2009/2010}, volume = {14}, journal = {Wissenschaftliche Beitr{\"a}ge 2009/2010}, issn = {0949-8214}, doi = {10.15771/0949-8214_2010_1_2}, url = {http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:kobv:526-opus-810}, pages = {13 -- 22}, year = {2010}, abstract = {Es wurde ein Elektrodensystem entwickelt, das aufbauend auf Halbleiternanopartikeln (so genannte Quantenpunkte) die sensitive Detektion des Enzymkofaktors NADH (nicotinamide adenine dinucleotide) erlaubt. Kolloidale halbleitende CdSe/ZnS-Nanokristalle sind durch ein Dithiol {\"u}ber Chemisorption an Gold gebunden. Das Stromsignal kann durch die Beleuchtung der Quantenpunkt modifizierten Oberfl{\"a}che beeinflusst werden. Durch Photoanregung entstehen Elektron-Loch- Paare in den Nanopartikeln, die als anodischer oder kathodischer Photostrom detektiert werden k{\"o}nnen. Die Immobilisierung der Nanokristalle ist durch amperometrische Photostrom- und Quarzmikrowaage-Messungen (quartz crystal microbalance) verifiziert. Diese Studie zeigt, dass CdSe/ZnS-Quantenpunktmodifizierte Elektroden eine konzentrationsabh{\"a}ngige NADH-Detektion im Bereich von 20μM bis 2mM bei relativ niedrigem Potential (um 0V vs Ag/AgCl, 1 M KCl) erm{\"o}glichen. Somit k{\"o}nnen solche Elektroden in Kombination mit NADH-produzierenden Reaktionen f{\"u}r die lichtgesteuerte Analyse der entsprechenden Substrate des Biokatalysators genutzt werden. Es wird gezeigt, dass mit einem solchen Elektrodensystem und Photostrommessungen ein Glukosenachweis m{\"o}glich ist.}, language = {de} } @misc{TanneGoebelLisdat2011, author = {Tanne, Christoph K. and G{\"o}bel, Gero and Lisdat, Fred}, title = {Entwicklung einer Glucosedehydrogenase-basierten Anode und deren Anwendung in einer Glucose/O2-Biobrennstoffzelle}, series = {Wissenschaftliche Beitr{\"a}ge 2011}, volume = {15}, journal = {Wissenschaftliche Beitr{\"a}ge 2011}, issn = {0949-8214}, doi = {10.15771/0949-8214_2011_1_2}, url = {http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:kobv:526-opus-1039}, pages = {13 -- 21}, year = {2011}, abstract = {Unter Verwendung von mehrwandigen Kohlenstoffnanor{\"o}hren wurde in dieser Studie eine neuartige Anode zum Einsatz in Biobrennstoffzellen entwickelt. Dazu wurde das rekombinante Enzym Pyrrolochinolinchinon(PQQ)- abh{\"a}ngige Glucosedehydrogenase kovalent an eine aus PQQ bestehenden Zwischenschicht gekoppelt, welche zuvor an die Kohlenstoffnanor{\"o}hren adsorbiert war. Die Nanor{\"o}hren wurden aufgrund ihrer Thiolmodifikation chemisorptiv auf einer Goldelektrode gebunden. In glucosehaltiger L{\"o}sung konnte der Start eines katalytischen Stroms bei einem Potential von -80 mV vs. Ag/AgCl (1 MKCl) beobachtet werden. Unter Substrats{\"a}ttigung wurden Stromdichten im Bereich von 170 bis 200 μA/cm2 gemessen. Dieses System basiert auf einem mediatorvermittelten Elektronentransfer. Die entwickelte (PQQ)-GDH-MWCNT-Elektrode wurde mit einer MWCNT-modifizierten Elektrode kombiniert, bei der Bilirubinoxidase (BOD) als Biokatalysator fungiert. Daraus resultierte eine membranfreie Biobrennstoffzelle mit einem leichgewichtspotential von 600 mV und Leistungsdichten im Bereich von 20-25 μW/cm2.}, language = {de} } @article{FeifelStiegerKappetal.2016, author = {Feifel, Sven Christian and Stieger, Kai Ralf and Kapp, Andreas and Weber, Dennis and Allegrozzi, Marco and Piccioli, Mario and Turano, Paola and Lisdat, Fred}, title = {Insights into Interprotein Electron Transfer of Human Cytochrome c Variants Arranged in Multilayer Architectures by Means of an Artificial Silica Nanoparticle Matrix}, series = {ACS Omega}, volume = {1}, journal = {ACS Omega}, number = {6}, issn = {2470-1343}, doi = {10.1021/acsomega.6b00213}, url = {http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:kobv:526-opus4-6753}, pages = {1058 -- 1066}, year = {2016}, abstract = {The redox behavior of proteins plays a crucial part in the design of bioelectronic systems. We have demonstrated several functional systems exploiting the electron exchange properties of the redox protein cytochrome c (cyt c) in combination with enzymes and photoactive proteins. The operation is based on an effective reaction at modified electrodes but also to a large extent on the capability of self-exchange between cyt c molecules in a surface-fixed state. In this context, different variants of human cyt c have been examined here with respect to an altered heterogeneous electron transfer (ET) rate in a monolayer on electrodes as well as an enhanced self-exchange rate while being incorporated in multilayer architectures. For this purpose, mutants of the wild-type (WT) protein have been prepared to change the chemical nature of the surface contact area near the heme edge. The structural integrity of the variants has been verified by NMR and UV-vis measurements. It is shown that the single-point mutations can significantly influence the heterogeneous ET rate at thiol-modified gold electrodes and that electroactive protein/silica nanoparticle multilayers can be constructed with all forms of human cyt c prepared. The kinetic behavior of electron exchange for the mutant proteins in comparison with that of the WT has been found altered in some multilayer arrangements. Higher self-exchange rates have been found for K79A. The results demonstrate that the position of the introduced change in the charge situation of cyt c has a profound influence on the exchange behavior. In addition, the behavior of the cyt c variants in assembled multilayers is found to be rather similar to the situation of cyt c self-exchange in solution verified by NMR.}, language = {en} } @article{WegerichTuranoAllegrozzietal.2009, author = {Wegerich, F. and Turano, Paola and Allegrozzi, Marco and M{\"o}hwald, H. and Lisdat, Fred}, title = {Superoxide Biosensing with Engineered Cytochrome c}, series = {Procedia Chemistry}, volume = {1}, journal = {Procedia Chemistry}, number = {1}, issn = {1876-6196}, doi = {10.1016/j.proche.2009.07.321}, url = {http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:kobv:526-opus4-6523}, pages = {1287 -- 1290}, year = {2009}, abstract = {Several mutation positions have been chosen for introducing positively charged lysines in human cytochrome c (cyt c) with the aim of increasing the reaction rate with superoxide radicals (SO) and thus, the sensitivity of an electrochemical cyt c based SO biosensor. The impact of the mutations on structural and redox properties as well as on the reaction rate with SO are verified. Four mutants show a higher reaction rate with the radical compared to the wild type. These mutants are used for the construction of SO sensors based on thiol-modified gold electrodes and covalently fixed proteins. The E66K mutant electrode has a clearly higher sensitivity in comparison to the wildtype based sensor.}, language = {en} } @article{RiedelHoefsRuffetal.2021, author = {Riedel, Marc and H{\"o}fs, Soraya and Ruff, Adrian and Schuhmann, Wolfgang and Lisdat, Fred}, title = {A Tandem Solar Biofuel Cell: Harnessing Energy from Light and Biofuels}, series = {Angewandte Chemie International Edition}, volume = {60}, journal = {Angewandte Chemie International Edition}, number = {4}, publisher = {Wiley}, issn = {1521-3773}, doi = {10.1002/anie.202012089}, url = {http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:kobv:526-opus4-13680}, pages = {2078 -- 2083}, year = {2021}, abstract = {We report on a photobioelectrochemical fuel cell consisting of a glucose-oxidase-modified BiFeO3 photobiocathode and a quantum-dot-sensitized inverse opal TiO2 photobioanode linked to FAD glucose dehydrogenase via a redox polymer. Both photobioelectrodes are driven by enzymatic glucose conversion. Whereas the photobioanode can collect electrons from sugar oxidation at rather low potential, the photobiocathode shows reduction currents at rather high potential. The electrodes can be arranged in a sandwich-like manner due to the semi-transparent nature of BiFeO3, which also guarantees a simultaneous excitation of the photobioanode when illuminated via the cathode side. This tandem cell can generate electricity under illumination and in the presence of glucose and provides an exceptionally high OCV of about 1 V. The developed semi-artificial system has significant implications for the integration of biocatalysts in photoactive entities for bioenergetic purposes, and it opens up a new path toward generation of electricity from sunlight and (bio)fuels.}, language = {en} } @article{Lisdat2020, author = {Lisdat, Fred}, title = {Coupling biology to electrochemistry—future trends and needs}, series = {Journal of Solid State Electrochemistry}, volume = {24}, journal = {Journal of Solid State Electrochemistry}, publisher = {Springer Nature}, issn = {1433-0768}, doi = {10.1007/s10008-020-04714-y}, url = {http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:kobv:526-opus4-13639}, pages = {2125 -- 2127}, year = {2020}, abstract = {The coupling of biological entities with electrodes has already quite some history and has reached a status which is not only based on phenomenological descriptions. Nowadays, we are able to effectively couple redox centres within protein molecules to electrochemical transducers. This allows the transduction of a biochemical reaction into an electrode signal with applications mainly in sensing and bioenergetics [1,2,3,4,5,6,7,8]. However, in most cases, this coupling is not direct, and shuttle molecules or side products of the reaction are used. But also for the direct coupling, significant progress has been made, and several enzymes and redox proteins can be addressed directly by electrodes [8,9,10,11,12,13]. The understanding of the functioning of developed systems is, however, in its infancy. Charge and electrostatic interactions have been mostly studied, and for small dipole molecules such as cytochrome c, the situation can be well described [14]. There is a lack of understanding for more complex enzyme molecules which brings a lot of trial and error into research.}, language = {en} } @article{ZhaoRiedelPatarroyoetal.2022, author = {Zhao, Shuang and Riedel, Marc and Patarroyo, Javier and Bast{\´u}s, Neus G. and Puntes, Victor and Zhao, Yue and Lisdat, Fred and Parak, Wolfgang J.}, title = {Tailoring of the photocatalytic activity of CeO₂ nanoparticles by the presence of plasmonic Ag nanoparticles}, series = {Nanoscale}, volume = {14}, journal = {Nanoscale}, publisher = {Royal Society of Chemistry (RSC)}, url = {http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:kobv:526-opus4-16361}, pages = {12048 -- 12059}, year = {2022}, abstract = {The present study investigates basic features of a photoelectrochemical system based on CeO2 nanoparticles fixed on gold electrodes. Since photocurrent generation is limited to the absorption range of the CeO2 in the UV range, the combination with metal nanoparticles has been studied. It can be shown that the combination of silver nanoparticles with the CeO2 can shift the excitation range into the visible light wavelength range. Here a close contact between both components has been found to be essential and thus, hybrid CeO2@Ag nanoparticles have been prepared and analyzed. We have collected arguments that electron transfer occurs between both compositional elements of the hybrid nanoparticles.The photocurrent generation can be rationalized on the basis of an energy diagram underlying the necessity of surface plasmon excitation in the metal nanoparticles, which is also supported by wavelength-dependent photocurrent measurements. However, electrochemical reactions seem to occur at the CeO2 surface and consequently, the catalytic properties of this material can be exploited as exemplified with the photoelectrochemical reduction of hydrogen peroxide. It can be further demonstrated that the layer-by layer technique can be exploited to create a multilayer system on top of a gold electrode which allows the adjustment of the sensitivity of the photoelectrochemical system. Thus, with a 5-layer electrode with hybrid CeO2@Ag nanoparticles submicromolar hydrogen peroxide concentrations can be detected.}, language = {en} } @article{KoelschRadonGolubetal.2020, author = {K{\"o}lsch, Adrian and Radon, C. and Golub, M. and Baumert, A. and B{\"u}rger, J{\"o}rg and Mielke, Thorsten and Lisdat, Fred and Feoktystov, A. and Pieper, J. and Zouni, Athina and Wendler, P.}, title = {Current limits of structural biology: The transient interaction between cytochrome c6 and photosystem I}, series = {Current Research in Structural Biology}, volume = {2}, journal = {Current Research in Structural Biology}, issn = {2665-928X}, doi = {10.1016/j.crstbi.2020.08.003}, url = {http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:kobv:526-opus4-13628}, pages = {171 -- 179}, year = {2020}, abstract = {Trimeric photosystem I from the cyanobacterium Thermosynechococcus elongatus (TePSI) is an intrinsic membrane protein, which converts solar energy into electrical energy by oxidizing the soluble redox mediator cytochrome c6 (Cyt c6) and reducing ferredoxin. Here, we use cryo-electron microscopy and small angle neutron scattering (SANS) to characterize the transient binding of Cyt c6 to TePSI. The structure of TePSI cross-linked to Cyt c6 was solved at a resolution of 2.9 {\AA} and shows additional cofactors as well as side chain density for 84\% of the peptide chain of subunit PsaK, revealing a hydrophobic, membrane intrinsic loop that enables binding of associated proteins. Due to the poor binding specificity, Cyt c6 could not be localized with certainty in our cryo-EM analysis. SANS measurements confirm that Cyt c6 does not bind to TePSI at protein concentrations comparable to those for cross-linking. However, SANS data indicate a complex formation between TePSI and the non-native mitochondrial cytochrome from horse heart (Cyt cHH). Our study pinpoints the difficulty of identifying very small binding partners (less than 5\% of the overall size) in EM structures when binding affinities are poor. We relate our results to well resolved co-structures with known binding affinities and recommend confirmatory methods for complexes with KM values higher than 20 μM.}, language = {en} } @misc{SchubartGoebelLisdat2013, author = {Schubart, Ivo and G{\"o}bel, Gero and Lisdat, Fred}, title = {Direkte Kontaktierung des Enzyms (PQQ)-GDH und Elektroden mit Hilfe von polymermodifizierten Nanor{\"o}hren f{\"u}r die Anwendung in Biobrennstoffzellen}, series = {Wissenschaftliche Beitr{\"a}ge 2013}, volume = {17}, journal = {Wissenschaftliche Beitr{\"a}ge 2013}, issn = {0949-8214}, doi = {10.15771/0949-8214_2013_1_3}, url = {http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:kobv:526-opus4-3127}, pages = {17 -- 22}, year = {2013}, abstract = {In dieser Studie pr{\"a}sentieren wir eine Enzymelektrode, bei der ein direkter Elektronentransfer (DET) zwischen der Pyrrolochinolinchinon-abh{\"a}ngigen Glukosedehydrogenase (PQQ)-GDH und einer Elektrode realisiert werden konnte. Hierf{\"u}r wird eine Goldelektrode mit mehrwandigen Kohlenstoffnanor{\"o}hren [engl. multi-walled carbon nanotubes (MWCNT)] modifiziert, anschließend mit einem Copolymer aus Anilinderivaten {\"u}berzogen und dann die (PQQ)-GDH (Acinetobacter calcoaceticus) kovalent immobilisiert. Die gepulste Polymersynthese wird hinsichtlich der Effektivit{\"a}t der bioelektrokatalytischen Umsetzung von Glukose optimiert. Die Glukoseoxidation startet bei einem Potential von -0,1 V vs. Ag/AgCl (1 M KCl) und Stromdichten von bis zu 500 μA/cm² (+0,1 V) k{\"o}nnen erreicht werden. Der Messbereich f{\"u}r Glukose liegt bei 0,1-5 mM (+0,1 V vs. Ag/AgCl). Der dynamische Bereich ist bei h{\"o}herem Potential auf bis zu 100 mM (+0,4 V vs Ag/AgCl) erweitert. Die Elektrode wird als Anode in einer Biobrennstoffzelle (BBZ) mit einer Bilirubinoxidase-modifizierten MWCNT/Gold-Kathode eingesetzt. Beide Elektroden basieren auf einem DET. Das Zellpotential der BBZ betr{\"a}gt 680 ±20 mV und sie erreicht eine maximale Leistungsdichte von 65 μW/cm² (bei einer Zellspannung von 350 mV).}, language = {de} } @misc{RiedelKartchemnikSchoeningetal.2015, author = {Riedel, Marc and Kartchemnik, Julia and Sch{\"o}ning, Michael J. and Lisdat, Fred}, title = {Impedimetrischer DNA Nachweis - Schritte in Richtung sensorischer Anwendung}, series = {Wissenschaftliche Beitr{\"a}ge 2015}, volume = {19}, journal = {Wissenschaftliche Beitr{\"a}ge 2015}, issn = {0949-8214}, doi = {10.15771/0949-8214_2015_1_3}, url = {http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:kobv:526-opus4-3538}, pages = {21 -- 28}, year = {2015}, abstract = {Diese Studie beschreibt einen labelfreien impedimetrischen Sensor auf der Grundlage von kurzen einzelstr{\"a}ngigen DNA-Erkennungselementen f{\"u}r den Nachweis von Hybridisierungsereignissen. Der Fokus der Arbeit liegt auf der Aufkl{\"a}rung des Einflusses der Ziel-DNA-L{\"a}nge und der Erkennungssequenzposition auf die sensorische Leistungsf{\"a}higkeit. Die impedimetrischen Messungen werden in Anwesenheit des Redoxsystems Kaliumhexacyanoferrat (II/III) durchgef{\"u}hrt und zeigen einen Anstieg des Durchtrittswiderstandes nach der Hybridisierung mit komplement{\"a}rer Ziel-DNA mit einer Nachweisgrenze im unteren nanomolaren Bereich. Nach der Hybridisierung kann die Regeneration des Sensors mit deionisiertem Wasser durch die Einstellung effektiver Konvektionsbedingungen erreicht werden und erm{\"o}glicht somit eine Wiederverwendbarkeit des Sensors. Untersuchungen zu l{\"a}ngeren Ziel-DNA-Str{\"a}ngen mit einem zur L{\"o}sung exponierten {\"U}berhang demonstrieren die Anwendbarkeit des impedimetrischen Nachweises f{\"u}r l{\"a}ngere Sequenzen. Allerdings resultiert eine zunehmende {\"U}berhangl{\"a}nge in einer verringerten Durchtrittswiderstands{\"a}nderung. Um die Impedanz{\"a}nderung f{\"u}r l{\"a}ngere Ziel-DNA zu erh{\"o}hen, wird die Erkennungssequenzposition ver{\"a}ndert, sodass ein kleiner {\"U}berhang zur Elektrode ausgerichtet ist. Die Ergebnisse legen nahe, dass DNA in direkter N{\"a}he zur Elektrode einen gr{\"o}ßeren Einfluss auf das impedimetrische Signal besitzt als weiter entfernte DNA.}, language = {de} } @misc{SarauliXuDietzeletal.2014, author = {Sarauli, David and Xu, Chenggang and Dietzel, Birgit and Schulz, Burkhard and Lisdat, Fred}, title = {Effekt unterschiedlich substituierter sulfonierter Polyaniline auf den Elektronentransfer mit pyrrolochinolinchinonabh{\"a}ngiger Glukosehydrogenase}, series = {Wissenschaftliche Beitr{\"a}ge 2014}, volume = {18}, journal = {Wissenschaftliche Beitr{\"a}ge 2014}, issn = {0949-8214}, doi = {10.15771/0949-8214_2014_1_1}, url = {http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:kobv:526-opus4-3285}, pages = {7 -- 15}, year = {2014}, abstract = {Sulfonierte Polyaniline erwiesen sich bereits als geeignete Polymere f{\"u}r den Aufbau von Biosensoren. Aus diesem Grund setzten wir unterschiedlich substituierte Polymerformen f{\"u}r die Untersuchungen der direkten Elektronen{\"u}bertragung zum Redoxenzym PQQ-GDH (Pyrrolochinolinchinon-abh{\"a}ngige Glukosedehydrogenase) ein. Daf{\"u}r wurden zuerst neue Copolymere synthetisiert. Als Basis f{\"u}r die Synthesen wurden 2-Methoxyanilin-5-Sulfons{\"a}ure (MAS), 3-Aminobenzensulfons{\"a}ure (ABS), 3-Aminobenzoes{\"a}ure (AB) und Anilin (AN) ausgew{\"a}hlt und deren Verh{\"a}ltnisse variiert. Alle Copolymere wurden hinsichtlich der direkten Reaktion mit PQQ-GDH untersucht. Diese Wechselwirkung wurde zun{\"a}chst in L{\"o}sung, anschließend auch auf Elektroden beobachtet. Die Ergebnisse zeigen, dass nur die aus MAS- und AN-Einheiten bestehenden Copolymere in der Lage sind, mit dem Enzym in L{\"o}sung direkt zu interagieren, was wahrscheinlich dem Emeraldin Salz (ES) Redoxzustand des Polymers zuzuschreiben ist. Immobilisiert man die Polymere und das Enzym auf Kohlenstoffnanor{\"o}hrenbasierten Elektroden, generiert man direkte Bioelektrokatalyse auch im Falle der aus ABS/AB- und MAS/AB-Einheiten bestehenden Copolymere, die sich nach der Synthese im Pernigranilin Base (PB) Redoxzustand befinden. Im Gegensatz zur Situation in L{\"o}sung kann auf Elektroden das Potential zus{\"a}tzlich genutzt werden, um Elektronen vom Enzym auf das Polymer zu {\"u}bertragen. Solche Polymerbasierten Enzymelektroden besitzen Anwendungspotential in der Sensorik, aber auch in Biobrennstoffzellen.}, language = {de} } @misc{VogtLisdat2004, author = {Vogt, Christian and Lisdat, Fred}, title = {BioHyTec: Biohybride Technologien in der Hauptstadtregion - Kompetenzbildung und Aufbau einer regionalen Wertsch{\"o}pfungskette}, series = {Wissenschaftliche Beitr{\"a}ge 2004}, volume = {9}, journal = {Wissenschaftliche Beitr{\"a}ge 2004}, issn = {0949-8214}, doi = {10.15771/0949-8214_2004_1_15}, url = {http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:kobv:526-opus4-4094}, pages = {97 -- 102}, year = {2004}, abstract = {Das Bundesministerium f{\"u}r Bildung und Forschung (BMBF) startete 1999 mit dem InnoRegio-Wettbewerb eine neuartige F{\"o}rderinitiative unter der Leitidee „Innovative Impulse in den Neuen L{\"a}ndern". In zahlreichen Regionen wurden Aktivit{\"a}ten in Gang gesetzt, um neue Formen der Zusammenarbeit von Menschen aus den unterschiedlichsten Bereichen zu entwickeln und damit die Wertsch{\"o}pfung und Wettbewerbsf{\"a}higkeit in den ostdeutschen Regionen zu erh{\"o}hen. An dieser Ausschreibung nahmen in der Anfangsphase 444 Bewerberregionen teil. Nach der ersten Jury-Sitzung im Oktober 1999 wurden 50 InnoRegios ausgew{\"a}hlt, in einer Entwicklungsphase ihre Kernkompetenzen herauszufiltern und tragf{\"a}hige Innovationskonzepte zu erarbeiten. Mit der zweiten Jury-Sitzung im Herbst 2000 fiel der Startschuss zur Umsetzungsphase. Zur Zeit werden vom BMBF 23 InnoRegios in den Neuen L{\"a}ndern gef{\"o}rdert.}, language = {de} } @article{MorlockSubramanianZounietal.2022, author = {Morlock, Sascha and Subramanian, Senthil Kumar and Zouni, Athina and Lisdat, Fred}, title = {Bio-inorganic hybrid structures for direct electron transfer to photosystem I in photobioelectrodes}, series = {Biosensors and Bioelectronics}, volume = {204}, journal = {Biosensors and Bioelectronics}, publisher = {Elsevier}, issn = {1873-4235}, url = {http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:kobv:526-opus4-16770}, year = {2022}, abstract = {Synthetic materials can be combined with biological components in many ways. One example that provides scientists with multiple challenges is a photobioelectrode that converts sunlight into electrons in a biohybrid approach. In the present study several key parameters are evaluated concerning their influence on the direct electron transfer from a 3D indium tin oxide (ITO) electrode material to photosystem I (PSI) as a light-harvesting biomolecule. In contrast to previous investigations, no mediating molecule is added to shuttle the electrons to the luminal side of PSI. Thus, this setup is less complex than foregoing ones. The solution composition drastically influences the interaction of PSI with the ITO surface. Here, the application of higher buffer concentrations and the addition of salts are advantageous, whereas the nature of the buffer ions plays a minor role. The artificial electrode material's thickness is adjustable since a spin-coating procedure is used for preparation. With a 30 μm thick structure and immobilized PSI cathodic photocurrents up to 10.1 μA cm-2 are obtained at 100 mW cm-2 illumination intensity and an applied potential of -0.1V vs. Ag/AgCl. Over a period of three days the photobioelectrodes are illuminated for a total of 90 min and stored between the measurements at ambient temperature. The stability of the setup is noteworthy as still about 90\% of the photocurrent is retained. The photocathode described here offers many positive features, including a high onset potential for the photocurrent starting sligthly above the redox potentail of P700, and applicability in a wide pH range from pH 5 to 8.}, language = {en} } @article{KhalidGoebelHuehnetal.2011, author = {Khalid, Waqas and G{\"o}bel, Gero and H{\"u}hn, Dominik and Montenegro, Jose-Maria and Rivera-Gil, Pilar and Lisdat, Fred and Parak, Wolfgang J.}, title = {Light triggered detection of aminophenyl phosphate with a quantum dot based enzyme electrode}, series = {Journal of Nanobiotechnology}, volume = {9}, journal = {Journal of Nanobiotechnology}, number = {46}, issn = {1477-3155}, url = {http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:kobv:526-opus4-5808}, pages = {10}, year = {2011}, abstract = {An electrochemical sensor for p-aminophenyl phosphate (p APP) is reported. It is based on the electrochemical conversion of 4-aminophenol (4AP) at a quantum dot (QD) modified electrode under illumination. Without illumination no electron transfer and thus no oxidation of 4AP can occur. p APP as substrate is converted by the enzyme alkaline phosphatase (ALP) to generate 4AP as a product. The QDs are coupled via 1,4-benzenedithiol (BDT) linkage to the surface of a gold electrode and thus allow potential-controlled photocurrent generation. The photocurrent is modified by the enzyme reaction providing access to the substrate detection. In order to develop a photobioelectrochemical sensor the enzyme is immobilized on top of the photo-switchable layer of the QDs. Immobilization of ALP is required for the potential possibility of spatially resolved measurements. Geometries with immobilized ALP are compared versus having the ALP in solution. Data indicate that functional immobilization with layer-by-layer assembly is possible. Enzymatic activity of ALP and thus the photocurrent can be described by Michaelis- Menten kinetics. p APP is detected as proof of principle investigation within the range of 25 μM - 1 mM.}, language = {en} } @article{FeifelLisdat2011, author = {Feifel, Sven Christian and Lisdat, Fred}, title = {Silica nanoparticles for the layer-by-layer assembly of fully electro-active cytochrome c multilayers}, series = {Journal of Nanobiotechnology}, volume = {9}, journal = {Journal of Nanobiotechnology}, number = {59}, issn = {1477-3155}, url = {http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:kobv:526-opus4-5819}, pages = {12}, year = {2011}, abstract = {For bioanalytical systems sensitivity and biomolecule activity are critical issues. The immobilization of proteins into multilayer systems by the layer-by-layer deposition has become one of the favorite methods with this respect. Moreover, the combination of nanoparticles with biomolecules on electrodes is a matter of particular interest since several examples with high activities and direct electron transfer have been found. Our study describes the investigation on silica nanoparticles and the redox protein cytochrome c for the construction of electro-active multilayer architectures, and the electron transfer within such systems. The novelty of this work is the construction of such artificial architectures with a non-conducting building block. Furthermore a detailed study of the size influence of silica nanoparticles is performed with regard to formation and electrochemical behavior of these systems.}, language = {en} }