Corundum Particles as Trypsin Carrier for Efficient Protein Digestion

  • This dataset contains raw LC–MS/MS files of trypsin-digested NISTmAb acquired on a SCIEX TripleTOF 6600 mass spectrometer in DIA (SWATH) mode for antibody quantification. In addition, it includes MALDI-TOF MS peptide mass fingerprints of trypsin-digested Herceptin as well as reference spectra that can be used for antibody identification using the open-source software ABID 2.0 (https://bam.de/ABID). The data were generated within a study demonstrating the applicability of corundum-immobilized trypsin for antibody digestion and its suitability for peptide-based LC–MS/MS quantification and MALDI-TOF MS fingerprinting–based antibody identification.

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Autor*innen:Sarah DöringORCiD
Koautor*innen:Birte S. Wulfes, Aleksandra Atanasova, Carsten JaegerORCiD, Leopold Walzel, Georg TscheuschnerORCiD, Sabine Flemig, Kornelia GawlitzaORCiD, Ines FeldmannORCiD, Zoltán KonthurORCiD, Michael G. WellerORCiD
Dokumenttyp:Forschungsdatensatz
Veröffentlichungsform:Graue Literatur
Sprache:Englisch
Jahr der Erstveröffentlichung:2025
Organisationseinheit der BAM:1 Analytische Chemie; Referenzmaterialien
1 Analytische Chemie; Referenzmaterialien / 1.5 Proteinanalytik
1 Analytische Chemie; Referenzmaterialien / 1.8 Umweltanalytik
1 Analytische Chemie; Referenzmaterialien / 1.9 Chemische und optische Sensorik
4 Material und Umwelt
4 Material und Umwelt / 4.2 Material-Mikrobiom Wechselwirkungen
Herausgeber (Institution):Bundesanstalt für Materialforschung und -prüfung (BAM)
Verlag:Zenodo
Verlagsort:Geneva
DDC-Klassifikation:Technik, Medizin, angewandte Wissenschaften / Ingenieurwissenschaften / Ingenieurwissenschaften und zugeordnete Tätigkeiten
Freie Schlagwörter:ABID 2.0; Herceptin; MALDI-TOF MS peptide mass fingerprint; NISTmAb
Themenfelder/Aktivitätsfelder der BAM:Chemie und Prozesstechnik
Chemie und Prozesstechnik / Chemische Charakterisierung und Spurenanalytik
Material
Material / Advanced Materials
Art der Ressource:Datensatz
Ort der Datenerhebung:Berlin
DOI:10.5281/zenodo.17416536
Zugehöriger Identifikator:https://doi.org/10.3390/biotech15010002
Verfügbarkeit des Dokuments:Datei für die Öffentlichkeit verfügbar ("Open Access")
Datum der Freischaltung:20.01.2026
Referierte Publikation:Nein
Schriftenreihen ohne Nummerierung:Wissenschaftliche Artikel der BAM
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