TOPAS cell model with nanoparticles
- These files contain cell models for TOPAS/Geant4 and the inclusion of nano particles in particle scattering simulations. A simple spherical cell with nanoparticles can be generated in a fast manner. The user has the option to include the following organelles: nucleus, mitochondria, cell membrane. Additionally nanoparticles can be included in the cytosol and at the surface of the nucleus and/or the mitochondria. The C++ classes in this repository extend the functionality of the TOPAS (http://www.topasmc.org/) Monte-Carlo program, which is itself a wrapper of the Geant4 MCS Toolkit (http://geant4.org). The sourcecode together with examples and scorers are provided. "If you use this extension please cite the following literature: Hahn, M.B., Zutta Villate, J.M. "Combined cell and nanoparticle models for TOPAS to study radiation dose enhancement in cell organelles." Sci Rep 11, 6721 (2021). https://doi.org/10.1038/s41598-021-85964-2 "
Autor*innen: | Marc Benjamin HahnORCiD |
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Dokumenttyp: | Forschungsdatensatz |
Veröffentlichungsform: | Eigenverlag BAM |
Sprache: | Englisch |
Jahr der Erstveröffentlichung: | 2020 |
Organisationseinheit der BAM: | 6 Materialchemie |
6 Materialchemie / 6.6 Physik und chemische Analytik der Polymere | |
Verlag: | Bundesanstalt für Materialforschung und -prüfung (BAM) |
Verlagsort: | Berlin |
DDC-Klassifikation: | Technik, Medizin, angewandte Wissenschaften / Ingenieurwissenschaften / Ingenieurwissenschaften und zugeordnete Tätigkeiten |
Freie Schlagwörter: | AuNP; Cancer therapy; Cell; Dosimetry; Geant4; Gold; MCS; Microdosimetry; Mitochondria; Monte-Carlo simulation; Nanoparticle; Nanoparticles; Nucleus; Particle scattering; Radiation therapy; Simulation; TOPAS; TOPAS-nBio; Targeted nanoparticle |
Themenfelder/Aktivitätsfelder der BAM: | Material |
Material / Nano | |
Art der Ressource: | Software |
Ort der Datenerhebung: | Berlin, Germany |
Beginndatum der Datenerstellung: | 03.02.2020 |
Enddatum der Datenerstellung: | 28.08.2020 |
DOI: | 10.26272/opus4-51150 |
URL: | https://github.com/BAMresearch/TOPAS-CellModels |
URL: | https://github.com/MarcBHahn/TOPAS-CellModels |
Zugehöriger Identifikator: | https://opus4.kobv.de/opus4-bam/frontdoor/index/index/docId/52327 |
Beschreibung der Datei(en) : | Cell models for TOPAS/Geant4 and the inclusion of nano particles in particle scattering simulations.The C++ classes in this repository extend the functionality of the TOPAS (http://www.topasmc.org/) Monte-Carlo program, which is itself a wrapper of the Geant4 MCS Toolkit (http://geant4.org). |
Verfügbarkeit des Dokuments: | Datei für die Öffentlichkeit verfügbar ("Open Access") |
Lizenz (Deutsch): | Creative Commons - CC0 1.0 - Universell - Public Domain Dedication |
Datum der Freischaltung: | 20.10.2020 |
Referierte Publikation: | Nein |
Schriftenreihen ohne Nummerierung: | Forschungsdatensätze der BAM |