Ion-selective formation of a guanine quadruplex on DNA origami structures
- DNA origami nanostructures are a versatile tool that can be used to arrange functionalities with high local control to study molecular processes at a single-molecule level. Here, we demonstrate that DNA origami substrates can be used to suppress the formation of specific guanine (G) quadruplex structures from telomeric DNA. The folding of telomeres into G-quadruplex structures in the presence of monovalent cations (e.g. Na+ and K+) is currently used for the detection of K+ ions, however, with insufficient selectivity towards Na+. By means of FRET between two suitable dyes attached to the 3'- and 5'-ends of telomeric DNA we demonstrate that the formation of G-quadruplexes on DNA origami templates in the presence of sodium ions is suppressed due to steric hindrance. Hence, telomeric DNA attached to DNA origami structures represents a highly sensitive and selective detection tool for potassium ions even in the presence of high concentrations of sodium ions.
Autor*innen: | L. Olejko, P.J. Cywinski, Ilko Bald |
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Dokumenttyp: | Zeitschriftenartikel |
Veröffentlichungsform: | Verlagsliteratur |
Sprache: | Englisch |
Titel des übergeordneten Werkes (Englisch): | Angewandte Chemie / International Edition |
Jahr der Erstveröffentlichung: | 2014 |
Herausgeber (Institution): | Gesellschaft Deutscher Chemiker |
Verlag: | Wiley-VCH |
Verlagsort: | Weinheim |
Jahrgang/Band: | 53 |
Erste Seite: | 1 |
Letzte Seite: | 6 |
Freie Schlagwörter: | DNA nanotechnology; DNA origami; FRET; Fluorescence spectroscopy; G-quadruplexes; Nanostructures; Self-assembly; Sensing |
DOI: | 10.1002/anie.201409278 |
URL: | http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/anie.201409278/full |
ISSN: | 1433-7851 |
ISSN: | 1521-3773 |
ISSN: | 0570-0833 |
Verfügbarkeit des Dokuments: | Datei im Netzwerk der BAM verfügbar ("Closed Access") |
Datum der Freischaltung: | 20.02.2016 |
Referierte Publikation: | Ja |
Datum der Eintragung als referierte Publikation: | 11.12.2014 |