MetabolomicsBasics (R package to process and analyze metabolomics datasets)
- Raw data from metabolomics experiments are initially subjected to peak identification and signal deconvolution to generate raw data matrices m × n, where m are samples and n are metabolites. We describe here simple statistical procedures on such multivariate data matrices, all provided as functions in the programming environment R, useful to normalize data, detect biomarkers, and perform sample classification.
Autor*innen: | Jan LisecORCiD |
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Koautor*innen: | Carsten Jaeger |
Dokumenttyp: | Forschungsdatensatz |
Veröffentlichungsform: | Graue Literatur |
Sprache: | Englisch |
Jahr der Erstveröffentlichung: | 2018 |
Organisationseinheit der BAM: | 1 Analytische Chemie; Referenzmaterialien |
1 Analytische Chemie; Referenzmaterialien / 1.7 Organische Spuren- und Lebensmittelanalytik | |
1 Analytische Chemie; Referenzmaterialien / 1.8 Umweltanalytik | |
Herausgeber (Institution): | Bundesanstalt für Materialforschung und -prüfung (BAM) |
Verlag: | GitHub |
Verlagsort: | San Francisco, CA, USA |
DDC-Klassifikation: | Naturwissenschaften und Mathematik / Chemie / Analytische Chemie |
Freie Schlagwörter: | Data processing; Mass Spectrometry; R package; Software |
Themenfelder/Aktivitätsfelder der BAM: | Chemie und Prozesstechnik |
Art der Ressource: | Software |
URL: | https://github.com/cran/MetabolomicsBasics/ |
Zugehöriger Identifikator: | https://link.springer.com/protocol/10.1007/978-1-4939-7819-9_20 |
Verfügbarkeit des Dokuments: | Datei für die Öffentlichkeit verfügbar ("Open Access") |
Lizenz (Deutsch): | Creative Commons - CC BY - Namensnennung 4.0 International |
Datum der Freischaltung: | 06.07.2023 |
Referierte Publikation: | Nein |
Schriftenreihen ohne Nummerierung: | Forschungsdatensätze der BAM |