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Investigation of the ergopeptide epimerization process

  • Ergopeptides, like ergocornine and a-ergocryptine, exist in an S- and in an R-configuration. Kinetic experiments imply that certain configurations are preferred depending on the solvent. The experimental methods are explained in this article. Furthermore, computational methods are used to understand this configurational preference. Standard quantum chemical methods can predict the favored configurations by using minimum energy calculations on the potential energy landscape. However, the explicit role of the solvent is not revealed by this type of methods. In order to better understand its influence, classical mechanical molecular simulations are applied. It appears from our research that 'folding' the ergopeptide molecules into an intermediate state (between the S- and the R-configuration) is mechanically hindered for the preferred configurations.

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Autor*innen:K. Andrae, Stefan Merkel, V. Durmaz, K. Fackeldey, Robert Köppen, M. Weber, Matthias KochORCiD
Dokumenttyp:Zeitschriftenartikel
Veröffentlichungsform:Verlagsliteratur
Sprache:Englisch
Titel des übergeordneten Werkes (Englisch):Computation
Jahr der Erstveröffentlichung:2014
Veröffentlichende Institution:Bundesanstalt für Materialforschung und -prüfung (BAM)
Verlag:MDPI
Verlagsort:Basel
Jahrgang/Band:2
Ausgabe/Heft:3
Erste Seite:102
Letzte Seite:111
DDC-Klassifikation:Technik, Medizin, angewandte Wissenschaften / Ingenieurwissenschaften / Angewandte Physik
Freie Schlagwörter:Conformation; Epimerization; Ergopeptide; Hybrid monte carlo; Molecular dynamics; Quantum mechanics
DOI:10.3390/computation2030102
URN:urn:nbn:de:kobv:b43-324632
ISSN:2079-3197
Verfügbarkeit des Dokuments:Datei für die Öffentlichkeit verfügbar ("Open Access")
Lizenz (Deutsch):License LogoCreative Commons - Namensnennung
Datum der Freischaltung:20.02.2016
Referierte Publikation:Nein
Schriftenreihen ohne Nummerierung:Wissenschaftliche Artikel der BAM
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